一、研究新知
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Variant of TREM2 Associated with the Risk of Alzheimer’s Disease
(王姿乃教授、蔡易珊小姐摘譯)N Engl J Med 2013;368:107-16.
TREM2 Variants in Alzheimer’s Disease. N Engl J Med 2013;368:117-27.
Genetic Associations with Valvular Calcification and Aortic Stenosis. N Engl J Med 2013;368:503-12.由人類基因體計畫(Human Genome Project；HGP)揭開人類基因圖譜定序後，為了大量研究基因的單核苷酸多型性（Single Nucleotide Polymorphism，簡稱SNP）與疾病的關係，發展了人類全基因組關聯性研究(genome-wide association study ; GWAS)，目的試著從疾病族群與健康對照族群中找出高風險遺傳標記的基因SNPs與疾病間關聯，並隨著全球定序的公司如:Illumina Genome analyzer、Roche454 sequencer、Life Technologies SOLiD等大廠發展出更快速與高通量的定序方式揭開了next-generation sequencing之序幕，其方式從全組基因定序方式到外顯子定序(exome sequencing)更加速了研究基因SNPs與疾病發生的關聯。自第一篇在2005年Science期刊發表年齡與黃斑病變的GWAS，爾後在冠心病、第1、2型糖尿病、肥胖等數百種疾病涵蓋將近一千多篇的GWAS研究，找出與疾病相關的高風險變異基因的標記，儘管離臨床運用仍有一段路，但若能同時朝向轉譯功能(Translation phase)發展個人化早期診斷的檢驗與治療晶片仍是主要努力的方向。
GWAS研究法本身有其限制，必須避免假陽性的結果而造成的假相關，且再現性差，目前統計採用Bonferroni P值達 10−7，才具顯著意義，相對上就相當消耗研究成本；再者大部分有變異的標記其疾病的危險勝算值(Odds ratio) 平均為1.33。統合分析法(Meta-analysis)需嚴謹地探討統整的研究中是否存在異質性(Heterogeneity)以避免取樣誤差與刊登偏差（publication bias），而得一個整體的effect size與95% CI (confidence intervals)；今年2013至今三個月內新英格蘭雜誌已有三篇論文，透過統合分析法(Meta-analysis)整合其他的GWAS研究結果，提供再現性的解決方式；發現TREM2(rs75932628)的變異(R47H) 2.83 (1.45–5.40)為罹患阿茲海默症的高風險重要標記；Lipoprotein a (LPA) rs10455872 OR=2.05 (95%CI, 1.63-2.57, p=9.0×10−10) 為心臟瓣膜鈣化和主動脈瓣狹窄的重要標記。