高雄醫學大學的前身係自西元1954年創校的高雄醫學院，由臺灣第一位醫學博士杜聰明教授創建全國第一所私立醫學院，為臺灣地區理念獨具，歷史最悠久的私立醫學院。創校以來，辦學宗旨是為致力於「醫學暨其相關醫療之教育、研究、服務」，迄今已培育3萬餘名醫事相關人才。

為因應全校師生臨床教學、研究和實習的需要，並發展醫學科學之高深研究，西元1957年成立「附設中和紀念醫院」，為一級教學醫院及醫學中心，並負有國民保健和醫療的重責。西元1998年，本校接受高雄市政府委託經營「高雄市立小港醫院」，結合醫療與社區健康營造並發展成為區域級教學醫院。西元2003年6月6日啟用的啟川大樓，為南臺灣醫學中心的新里程碑，院內有最新穎、最完善的診治儀器，以及人性化的服務品質，除提供優質的醫療外，更強調對生命的尊重。西元2010年1月1日高醫大團隊正式接手經營「高雄市立大同醫院」，再度擴大醫療服務領域，並於一年後即升格為區域教學醫院，成為社會高度認同的全人照護社區醫院。創校近一甲子，本校肩負教育、研究、醫療、服務等四大任務，已成為南臺灣首要的醫學科學教育及醫療重鎮，並屢獲教育部中程校務發展計畫各項指標全優的肯定。

草創初期，第一屆僅招收醫科一個學系。日升月恆，新世紀的高醫大在101學年度已擁有7個學院、21個學系、5個獨立研究所;包含20個學士班、3個二年制在職專班、1個學士後學位學程、27個碩士班、7個碩士在職專班、9個博士班及3個博士學位學程，於本校歷史傳承中創新發展，更層疊出新的歷史紀錄。

第一任暨第三任董事長陳啟川先生，任職期間為1954－1966、1972－1993。第二任董事長洪壽南先生，任職期間為1966－1972。第四任董事長陳田植先生，自1993年任職迄今。

首任院長杜聰明博士任職12年（1954－1966），從十一甲的水田中建設第一棟、第二棟、第三棟灰色牆瓦的校舍及美援的紅磚圖書館，提出「樂學至上、研究第一」的教育理念，設立醫科、牙科及藥科，創辦「山地醫師醫學專修科」培訓山地醫師。發行《南杏》、《坩堝》、《高醫青年》等學生刊物及報紙。於1957年開辦附設醫院，設置門診部於六合二路，第二棟及第三棟校舍暫設為住院病房、開刀房等。

第二任魏火曜院長（任職期間1966－1967），在教育、人事、財務及管理各方面建立健全制度，鞏固行政核心，使高醫從草創時期邁向穩定中求成長。

第三任楊振忠院長（任職期間1967－1973），設立熱帶醫學中心、三年制護專，籌建附設醫院，1970年落成時，為紀念陳啟川先生尊翁陳中和先生而定名為「高雄醫學院附設中和紀念醫院」，為南臺灣醫療重鎮。

第四任謝獻臣院長（任職期間1973－1991），將4個學系擴增為12個學系、6個碩士班、3個博士班。並積極建設擴展校園景觀，興建綜合實驗大樓、學生宿舍、校友會館（校友捐建）、勵學大樓、濟世大樓等。為加強國際學術交流，與美國阿肯色大學簽訂為姐妹校，謝院長「堅忍自強，勵學濟世」的治校理念，更使高醫長足進步。

第五任蔡瑞熊院長/第一任校長（任職期間1991－2000），為高醫畢業校友之首位校長，除了興建醫學研究大樓、地下停車場外，受高雄市政府委託經營高雄市立小港醫院。更費心穩健學校財務，達成學校改名為大學，下設6個學院。以「微觀的探討生命奧秘，經身心健康的醫療服務，至宏觀的醫學與社會互動」為辦學理念，超越醫學範疇，擴展相關科學領域。

第二、三任王國照校長（任職期間2000－2006），提出「在既有堅實的基礎上，融新匯舊，重新塑成一所著有名聲，領袖群倫的國際一流大學」，打造高醫成為前瞻、宏觀的新世紀進步校園。任期間興建了第一教學大樓、學生宿舍及圖書館等。

第四、五任余幸司校長（任職期間2006－2012），沿續高醫關懷弱勢、醫療奉獻的傳統精神，培養學生認識國際人道援救與國際非政府組織的社會關懷精神，落實全人教育，以組織再造與管考機制，設置各種生物資訊、人力資源等資料庫，形成核心實驗室及核心管理單位外，更具體提出「教學卓越、研究創新、優質人文、社會關懷」的全方位發展策略，期能帶領高醫大成為獨具特色的醫學翹楚。任期中籌建第二教學研究大樓，並於2012年完工。

現任劉景寬校長(任職期間2012－迄今)，持續為本校定位注入生命價值的思維－－「維護生命、尊嚴、健康、福祉之人類價值」，在醫學教育與醫療服務上追求卓越，傳承濟世救人的高醫精神；提出「我愛高醫（I Love KMU）」治校理念（Innovation創新研發、Legislation法紀制度、Knowledge知識傳承、Mission使命榮譽、Universality國際視野），以「尊重生命，追求真理」為核心價值，進一步深耕培養學用合一、研用合一之跨領域健康專業人才，期能帶領本校成為具國際競爭力之頂尖醫學大學。

南椰之風、杏林大道，Dr. Patrick Manson的理想、史懷哲的典範。高醫半世紀的成長茁壯，匯聚歷年來師生員工之智慧與貢獻；58年之悠遠傳承，成為高醫創新卓越、永續發展的基業磐石。